1.备份数据库： MySQLdump -u[user] -p[password] [databasename] > [dbfile.sql] # 备份数据库。
2. /usr/local/mysql/bin/mysqladmin -u root -p shutdown #停止数据库 或者service mysql stop。
3. InnoDB表不支持全文搜索(fulltext search)，那么，记得要将备份出来的数据库sql，删掉有关 Fulltext 的索引。
4. cd /usr/local/mysql/support-files/找寻适合主机内存的设定文件，必将设定文件拷贝到 /etc/my.cnf。
5. vi /etc/my.cnf，将以下几项批注取消掉。以 my-large.cnf 为例。

innodb_data_file_path = ibdata1:10M:autoextend
　　innodb_buffer_pool_size = 256M
　　innodb_additional_mem_pool_size = 20M
　　innodb_log_file_size = 5M
　　innodb_log_buffer_size = 8M
　　innodb_flush_log_at_trx_commit = 1
　　innodb_lock_wait_timeout = 50
    加上default-storage-engine=innodb
　加上这段之后，以后新增的数据表型态都即是 InnoDB，不然每次新增一次数据表，SQL 后面得加上 ENGINE=InnoDB; 

6 .将刚刚备份出来的sql，将ENGINE=MyISAM改成ENGINE=InnoDB。
7. /usr/local/mysql/bin/safe_mysqld --user=mysql &  ，或service mysql start启动数据库
8.建立一个新的数据库(数据库名称跟备份出来的数据库名称一样)。
9. mysql -u[user] -p[password] [database_name] < [dbfile] #将改好的数据汇入数据库中！

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说明：
*设定文件的选择是参照内存大小来选择。
my-huge.cnf - 1G~2G 、my-large.cnf - 512M 、my-medium.cnf - 32M - 64M 、my-small.cnf <= 64M 。
InnoDB：my-innodb-heavy-4G.cnf
* 假如不会将备份出来的数据库改型态，那么您可以用下面这个指令，直接改变数据表的型态。

ALTER TABLE [tablename] ENGINE=InnoDB 如有存放全文索引功能的话，转换会失败的。

* 如你有一批数据表要改，可以用下面的指令：
 mysql_convert_table_format [opt] --ENGINE=InnoDB dbname [tablename]
但千万注意不要改变 mysql 数据库的数据型态，因为 mysql数据库存放的是 MySQL 内部的管理信息，所以必须保持 MyISAM 的格式。

*加大 tablespace 空间：
innodb_data_file_path = ibdata1:1G;ibdata2:1G:autoextend:max2G

　上面的意思是，tablespace 包含 ibdata1 & ibdata2 两个文件，若文件不存在，则建立容量各为1G的文件。一旦未来 InnoDB 需要，更多的空间，则 ibdata2 将每次自动增加 8MB，直到2G为止。

本文名称：MySQLMyISAM库转换为InnoDB的方法
标题来源：http://myzitong.com/article/jeedcp.html